記者在大佛左側的腋下看到了這樣一個洞。據劉淑琴介紹，塑像為了防蟲蛀，在底座上有兩個通氣孔，劉淑琴每年都會往里熏香，但今年放香進去，上面卻不冒煙，一時都不知道是怎么了。
不僅如此，有一回，北京的王毅男博士來到獨樂寺的觀音閣，他發現，在晴天的時候，部分壁畫泛黃，摸起來竟是濕濕的。與此同時，觀音閣里時不時有尸體腐爛的氣味，以及其他難聞的氣味。
所有這一切，在最初發現的時候都找不到答案，而外界傳聞越來越多。寺院工作人員認為，到了必須查出真相的時候了。
一天深夜，幾個人打著電筒，順著樓梯，慢慢爬上頂樓，在斗拱的間隙里，他們看到了數不清的蝙蝠。
“是的，就是蝙蝠。”劉淑琴肯定地說，“我們看到了蝙蝠，太多了，倒立懸掛在斗拱上。”
真相似乎在慢慢揭開，工作人員開始把所有的離奇現象跟蝙蝠聯系起來思考。
“那么多蝙蝠發出的聲音，就像是一群老鼠開會時的叫聲。”另一位工作人員介紹說，“我們都知道蝙蝠是吃蟲子的，白天休息，夜間活動。我們懷疑是蝙蝠堵住了熏香的洞，并且拉(灑)尿時把壁畫和佛像弄濕了，這個世界沒有什么鬼怪的。”
但是死魚和蝙蝠又是怎么回事？蝙蝠釣魚做什么？對此他們并不知道。于是，獨樂寺的管理者、薊縣文物保管所所長劉文山在4月底向中科院動物所的張樹義研究員發出了邀請，希望他能到薊縣徹查元兇。
五一假期，研究員帶著幾名動物學博士來到薊縣獨樂寺。
“張老師的脾氣大家都知道，一聽到新情況，他就一定要趕到現場去看。”中科院動物所的工作人員張金樹說。
張樹義，中國科學院動物研究所研究員、博士生導師。五一假期，研究員帶著幾名動物學博士專程來到薊縣獨樂寺，這些博士中包括專攻蝙蝠研究的王毅男。在觀音閣，他們抓住了幾只蝙蝠。
“那是我們認識的蝙蝠種類，所以我們一看就能叫出它們的名字。”張樹義在接受記者采訪時說，“它們是大足鼠耳蝠和水鼠耳蝠，其中絕大多數個體是大足鼠耳蝠。”
據介紹，大足鼠耳蝠是中國和亞洲近年來首次發現的食魚蝙蝠。
“除了吃蟲，它還吃魚。”王毅男說，“大足鼠耳蝠顧名思義就知道它有一對大腳�？梢詳喽ǖ氖�，觀音閣的小魚是由蝙蝠帶進來的。”
真相已經揭開，觀音閣里的奇怪現象林林總總，卻基本上都能同蝙蝠聯系在一起——夜晚，成群結隊的蝙蝠發出“吱吱吱吱”的聲音，它們飛出去捕魚，偶爾會抓幾只田螺從門縫往里鉆，它們排出的糞便淋濕了壁畫，它們的尸體堵住了熏香洞口……原來所謂的幽靈竟是這些小東西！
為什么不到別的場所，而恰恰在寺院安家落戶？
據獨樂寺工作人員反映，蝙蝠夜間大多懸掛在閣內的木制斗拱上。而記者在現場看到，這些斗拱參差不齊，錯落有致。
“只要不是很光滑的平面，都適合蝙蝠懸掛。”王毅南說，“大體上講，蝙蝠來到獨樂寺落窩的原因主要有兩個，一是外界逐漸喪失適合這些群居動物居住的陰涼干燥的場所，二是獨樂寺入夏后陰暗涼爽的環境吸引了它們。”
為了保護文物，工作人員四處驅趕“不速之客”，卻被張樹義制止了。
據了解，為了保護泥塑不再受蝙蝠尿液的侵蝕，工作人員每天都要用干凈的塑料布把塑像圍起來。蝙蝠在觀音閣寄居，對泥塑、壁畫和建筑本身的威脅越來越大。為了保護文物，工作人員四處驅趕這些“不速之客”，但這一“大掃蕩”被動物學家張樹義制止了。