敘利亞新成立的反對派組織“全國聯盟”主席哈提卜１９日與埃及外長穆罕默德·卡邁勒·阿姆魯會談后表示，“全國聯盟”總部將設在埃及。埃及外交部隨后發表聲明對此消息進行確認：“埃及將在未來向該組織提供一切所需幫助。”19日，敘利亞阿勒頗的武裝分子發布視頻，宣稱拒絕聽命于“全國聯盟”，并揚言要建伊斯蘭國家。美聯社稱，這一舉動表明敘利亞反對派內部的激烈斗爭，“事實上，在反對巴沙爾的整個過程中，反對派都一直受困于內部分歧”。
據埃及中東通訊社報道，哈提卜在談到設立總部時說，“全國聯盟”將在10天內在埃及首都開羅召開會議，并聽取那些沒有加入“全國聯盟”的團體的聲音。敘利亞“自由軍”20日宣布成立自己的情報機構。盡管敘利亞沖突已經持續了20多個月，但此前埃及對敘利亞反對派的支持遠不如卡塔爾、沙特、土耳其等國積極。對于埃及此次成為敘利亞新反對派聯盟大本營，開羅大學政治學教授哈桑20日對《環球時報》記者說，這表明穆爾西的敘利亞政策正在逐步“前進”。最開始，穆爾西6月底在就職演講中只是說“敘利亞人民的鮮血不能再流了”；到了8月份，穆爾西在伊斯蘭合作組織會議上表示“敘利亞現政權下臺的時間到了”；而今又允許敘反對派在埃及“安營扎寨”。哈桑認為，穆爾西希望遜尼派將巴沙爾推翻，這樣穆斯林兄弟會就可以在“后巴沙爾時代”獲得最大發言權。“穆爾西對待敘利亞問題的態度逐漸強硬，這在根本上是由國家利益所決定的。穆爾西曾對外界表示，我們不反對任何人，但我們要實現自己的國家利益”。
目前，海合會六國以及法國和土耳其都已承認“全國聯盟”是敘利亞人民的代表，法國甚至宣布該組織要向法國派駐大使。英國20日宣布正式承認敘利亞“全國聯盟”。歐盟19日也宣布“全國聯盟”是敘利亞人民的合法代表。意大利19日宣布承認“全國聯盟”，但尚不給予外交承認。
雖然得到西方承認，但“全國聯盟”在敘利亞國內的權威性卻受到挑戰。19日，網上出現一段由13個敘利亞激進組織發布的視頻。視頻顯示，20多名武裝分子散坐在長桌周圍，后面掛著一面黑色旗子，沒有表明身份的發言者坐在長桌一頭說：“我們是來自阿勒頗及周邊地區的武裝組織，我們完全拒絕‘全國聯盟’的陰謀，我們一致同意要在敘利亞建立伊斯蘭國家，拒絕那些總部設在外國的聯盟向我們發號施令”。武裝分子在視頻的最后還高舉《古蘭經》，稱要讓其成為敘利亞憲法。據悉，這些激進組織都是活躍在敘利亞前線的武裝分子，敘首都大馬士革發生的多起爆炸襲擊就是由他們制造的，其中有些組織還與“基地”組織有聯系。
目前，這段視頻的真實性難以確定。據卡塔爾半島電視臺引述上述激進組織發言人的話說，這段視頻只是組織內部個別武裝人員所為，并不能代表全部人的觀點。這段視頻也同時遭到敘許多反對派成員的批評，名叫穆罕默德·賽義德的反對派活動人士說：“不管視頻是真是假，敘利亞人民都支持‘全國聯盟’，我們這周五要在街上舉著‘支持敘利亞全國聯盟’的標語去游行。”
美國《華爾街日報》20日分析稱，反巴沙爾政權的伊斯蘭激進組織拒絕承認反對派聯盟，對“全國聯盟”能否實現自身目標提出了疑問，“‘全國聯盟’本想成為一支溫和的力量，減弱強硬派極端保守穆斯林的影響，并以此獲取外國盟友的資金和武器”。該報分析認為，如果伊斯蘭激進組織在反對派聯盟之外以其他身份作戰，將不利于“協調一致推翻巴沙爾”。